Как сообщил президент АФК «Система» Владимир Евтушенков, «есть намерение сделать вертикально интегрированную компанию». Ожидается, что новый нефтяной холдинг будет создан в первом квартале 2006 года. Создание вертикально интегрированной компании планируется с переводом всех предприятий на единую акцию. «Система» также сохраняет намерение увеличить свою долю в компаниях башкирского ТЭК. АФК хотела бы иметь 75% акций этого холдинга, с тем чтобы через 1,5−2 года продать его акции на открытом рынке или по закрытой подписке. В августе 2005 года АФК «Система» приобрела за $ 502,9 млн. у ООО «Башкирский капитал» по 19,9% ОАО «Ново-Уфимский НПЗ» («Новойл»), ОАО «Уфимский НПЗ», ОАО «Уфанефтехим», ОАО «АНК «Башнефть», ОАО «Уфаоргсинтез», а также 18,57% ОАО «Башкирнефтепродукт», 10,08% ОАО «Башкирэнерго». В октябре дополнительно приобрено 8,72% обыкновенных акций в ОАО «Новойл», 5,62% — в ОАО «Уфимский НПЗ», 2,53% — в ОАО «Уфанефтехим», 3,10% — в ОАО АНК «Башнефть», 4,97% — в ОАО «Уфаоргсинтез» на общую сумму $ 96,8 млн. В результате доля «Системы» в обыкновенных акциях «Новойла» выросла до 28,17%, в ОАО «Уфимский НПЗ» — до 25,52%, в ОАО «Уфанефтехим» — до 22,43%, в ОАО «Уфаоргсинтез» — до 24,87%. АФК «Система» также дополнительно приобрела 2% обыкновенных акций ОАО «Башнефть». Параллельно достигнуто соглашение по расторжению договора о приобретении 10,08% обыкновенных акций ОАО «Башкирэнерго». В результате доля АФК «Система» в «Башнефти» составила 25% обыкновенных акций, а доля в «Башкирэнерго» снизилась до нуля. Доля корпорации в ОАО «Башкирнефтепродукт» осталась неизменной — 18,57% обыкновенных акций. По завершении этой сделки общая сумма инвестиций АФК «Система» в пакеты акций перечисленных компаний составила $ 599,7 млн. Общая рыночная стоимость приобретенных пакетов акций оценивается в $ 1,223 млрд.